PATTERN-URI ȘI CODURI

Este vorba pe acest topic despre proprietățile de self-organizare ale naturii. Râurile, cascadele, dunele de nisip, uraganele, vreme și fulgii de nea toate se întâmplă FĂRĂ NICI O INTERVENȚIE DIN PARTEA UNUI ,,INTELLIGENT DESIGNER”. Pot aceste proprietăți de self-organizare să producă de asemenea ADN și forme de viață?

Patternurile care apar în mod natural
Natura produce pattern-uri prin ea însăși, fără ajutorul unui DESIGNER.
Exemple:
- Vremea, uragane, tornade,
- fulgi de zăpadă, cristale, stalagmite, dune de nisip,
- fractali și haos
Interacțiunile de fiecare zi ale materiei & energiei produc aceste patternuri

Design-urile
Acestea se bazează pe limbaj și simboluri.
Exemple:
- muzica, hărți, instrucțiuni
- limbaje umane: engleza, chineza, spaniola
- limbaje de computer: HTML, JPG,C++, TCP/IP, USB
- ADN
Design-urile ÎNTOTDEAUNA NECESITĂ UN DESIGNER

Există o mare schismă între cel mai complex pattern natural și cel mai simplu design. Toate design-urile încep cu reprezentare simbolică a ideilor printr-u cod, care este întotdeauna ,,designed”  (,,proiectat”, întocmit) de către o minte.

Haideți să vedem ce putem spune despre evoluție pornind de la această observație:
Nu toate pattern-urile sunt ,,designed”, dar toate design-urile conțin pattern-uri.
Am preferat să nu traduc aici cuv. ,,design”..

Diferența dintre un pattern și un cod este următoarea:

PATTERNURILE AU LOC ÎN NATURĂ TOT TIMPUL.
Exemple: fulgii de zăpadă, cristalele, uraganele, tornadele, râurile, liniile de coastă, etc.

UN COD ESTE ,,UN SISTEM DE SEMNALE FOLOSIT PENTRU A REPREZENTA LITERE SAU NUMERE ÎN MESAJELE TRANSMISE”.
CODURILE IMPLICĂ ÎNTOTDEAUNA UN SISTEM DE SIMBOLURI CARE REPREZINTĂ IDEI SAU PLANURI.
Exemple: engleza, chineza, limbajele de computer, muzica, semnale radio, etc.

TOATE CODURILE CONȚIN PATTERNURI, DAR NU TOATE PATTERNURILE CONȚIN CODURI. PATTERNURILE CARE SE ÎNTÂMPLĂ NATURAL NU CONȚIN COD.


Legat de informație: Werner Gitt, în cartea sa ,,In the beginning was information” oferă o prezentare formală riguroasă a mai multor concepte. Argumentul lui Gitt este sumarizat în 8 teoreme:
1. Nici o informație nu poate exista fără un cod
2. Nici un cod nu poate exista fără o convenție liberă și deliberată
3. Nici o informație nu poate exista fără cele 5 nivele ierarhice: statistică, sintaxă, semantică, pragmatică și apobetică (se referă la faptul că se poate arăta a fi un obiectiv mai larg și legat de intenție (scop, ,,will”), în spatele tuturor instanțelor intenției)
4. Nici o informație nu poate exista doar în procesele statistice
5. Nici o informație nu poate exista fără un transmițător
6. Nici un lanț informațiional nu poate exista fără o origine mentală
7. Nici o informație nu poate exista fără o sursă mentală inițială, adică, informația este, prin natura sa, o cantitate mentală și nu una materială.
8. Nici o informație nu poate exista fără intenție

Edited by shapeshifter, 04 August 2006 - 16:57.

Dorin Teodor are o carte pe tema asta.

Forma arborescenta a unei ape curgatoare, cuprinzand toti (sub-)afluentii, este pattern sau design?

cezar
P.S.  Multe din cele 8 teoreme de mai sus mi se par mai degraba ipoteze. Dar ma rog, deocamdata distinctia intre pattern si design (si ce intelegem ca-s ele) trebuie mai bine lamurita iar raspunsul la intrebarea de mai sus mi se pare destul de important.

Edited by blimpyway, 04 August 2006 - 19:00.

imi pare rau nu am apucat sa o citesc.. nu cunosc.. il invit aici sa vedem ce iese..

-----
Forma arborescenta a unei ape curgatoare, cuprinzand toti (sub-)afluentii, este pattern sau design?
-----
Dacă avem in vedere scopul apei, si nume de a urma diferite fire pentru a ajunge la o cota de nivel stationara, am putea spune ca exista intentionalitate.. ea urmeaza drumul cel mai scurt pe suprafata pe care o intalneste (in functie de relief).. dar informația inseamnă deja ,,intenționalitate", pe de alta parte nu poate exista nicio informație fără un cod.. se prea poate ca apa sa aiba deja codata in ea intentionalitate.. asta ar presupune un designer..

pe de alta parte s-ar putea spune ca e un pattern natural care apare din interactiunea dintre materie si energie.. dar apa are o proprietate foarte interesanta care iese la iveala in homeopatie.. atunci cind ultima molecula de substanta homeopata este inlaturată, efectul ramine!! Apa are un fel de memorie! Deci lucrurile sunt mult mai complicate decit par la prima vedere.. Apa pastreaza memoria ,,lucrurilor" cu care a interactionat.. asta arată ultimele cercetari in domeniu (vezi Mae-Wan Ho)..

Ce este informația?

1. în mod simbolic informația reprezintă altceva decît ea insăși (ex. cartea este ,,mai mult" decit hirtie și cerneală)
2. informația necesită un transmițător și un receptor
3. informația conține elemente de limbaj - alfabet, sintaxă, semnificație și intenție

Edited by shapeshifter, 04 August 2006 - 19:32.

 shapeshifter, on Aug 4 2006, 20:09, said:

Ok, sa nu intram in detalii privind proprietatile specifice ale apei - aceeasi forma ar lua-o in curgere orice lichid. Importanta e observatia ca curgerea apei scoate in evidenta proprietati ale formei  reliefului pe care il urmeaza - mai precis urmeaza calea minimului potential, scotand-o in evidenta.

Revenind la definitia termenului pattern - in dictionar sunt date multe utilizari ale cuvantului unele referitoare la sensul de design, proiect, plan (evident avand o intentie a unui creator in spate) dar acelasi termen e  folosit pentru a desemna  repetivitatea unor forme sau evenimente (de ex. miscarea astrelor)

In primul sens (al cuvantului) avem de-a face cu o intentie, proiect, in al doilea caz e vorba de observarea unor similaritati repetitive, fara a investiga cauza acestor similitudini.

Ambele sensuri implica repetivitatea ca proprietate intrinseca a patternului - nu putem vorbi de pattern daca acesta nu poate fi re-aplicat  (in cazul unui design) sau observat in mai multe exemplare.
-

Se poate spune ca patternul este rezultatul aplicarii repetate a unor functii/reguli/legi peste conditii initiale similare.
Investigarea cauzelor (legi, reguli, planuri) ce produce repetarea unor asemanari observabile   este operatiunea de descifrare a acestuia.
-------

As propune o definitie (in acest thread) acoperitoare pentru ambele sensuri ale cuvantului pattern :
Repetarea unor similaritati observabile

--------
P.S. Lozinca homeopatiei  "Simila similibus curantum" este foarte aproape de un principiu de baza in  magie "Simila similibus".
Principiu care postuleaza ca intre toate formele similare (pattern-uri) exista o legatura "invizibila", nu neaparat generativa.
Inainte ca stiinta sa caute sa descifreze cauzele producerii pattern-urilor, magia a incercat sa speculeze posibilele legaturi ascunse dintre lucrurile asemanatoare.

sa stii ca eu cind vorbeam despre ,,memoria" apei aveam în vedere ultimele descoperiri in domeniu:
http://www.i-sis.org.uk/water3.php
http://www.i-sis.org.uk/water1.php

ia uită-te:
First Sighting of Structured Water (02/11/05 )
http://www.i-sis.org...cturedWater.php

Articolul de la ultimul link nu are poze deoarece.. trebuie cumparat art. complet care contine si pozele..

------
Repetarea unor similaritati observabile
-------
ce înseamnă aici ,,similarități"? cum apar ele? cum din citeva legi simetrice iau nastere atitea efecte asimetrice?

ce zici de astea?
1) The element common to both watches and life is: Both are preceded by a language (plan) before they are built
2) The essential difference between naturally occurring pattern and an intelligent design is language
3) All language comes from a mind
4) Therefore all things containing language are designed

Limbajul ADN-ului:
1. ADN: Nucleotidă, LIMBAJ: caracter
2. ADN: codon, LIMBAJ: literă
3. ADN: genă, LIMBAJ: cuvînt
4. ADN: operon, LIMBAJ: frază
5. ADN: regulon, LIMBAJ: paragraf

Funcționarea ADN-ului:
- encodează toată informația necesară vieții
- elice dublă - se divide și bazele complementare se atașează pt. a forma copii
- alfabetul de 4 caractere al adeninei, timinei, citozinei, guaninei
- A,T,C,G sunt comparabile lui 1 și 0 din calculul binar al computerelor
- nr. de caractere din ADN: 500.000 (în cazul unui parazit unicelular) pînă la 3 miliarde (la om)
- ADN este un mecanism de encodare/decodare
- analiza lingvistică este folosită extensiv pentru a analiza ADN-ul

Dovada că ADN-ul a fost designed de către o Minte:
1. ADN-ul nu este numai o moleculă - este un sistem de codare cu un limbaj și un alfabet, conține un mesaj
2. Toate limbajele, codurile și mesajele vin dintr-o minte
3. De aceea ADN-ul a fost ,,designed" de către o Minte.

* orice am intelege prin Minte aici.. macar intuitiv sensul termenului Minte..

Edited by shapeshifter, 04 August 2006 - 21:02.

 shapeshifter, on Aug 4 2006, 13:15, said:

Si ce faci cu ADN-ul daca nu ai ARN  :lol:
Sau ce ai face cu ADN-ul daca nu ai proteine :lol:
Nu am auzit niciodata in viata mea de regulon, ce o fi ala :w00t:
Iti recomand sa citesti despre prioni, poate iti mai vin si alte idei, desi eu am impresia ca tu ingurgitezi informatii de pe anumite siteuri obscure si lre regurgitezi aici :death:

Daca urmaresti aparitia si evolutia vietii, e clar ca exista un design permanent. Adaptabilitatea e doar o functie a organismelor vii, si ea a fost proiectata, implementata de designer. Proiectul a evoluat si evolueaza in continuare, iar omul nu e obligatoriu sa fie rezultatul final, as inclina sa cred ca nu este si ca din om vor evolua alte specii, ideea ca aici s-a implinit proiectul mi se pare nejustificat de antropocentrista.

Este un "design" care a iesit castigator la un moment dat din mai multe "designuri". Asta se numeste evolutie si poate sa fie cat se poate de spontana. A avut nevoie doar de timp, care a fost din belsug.

 shapeshifter, on Aug 4 2006, 21:15, said:

In sensul simplu de lucruri asemanatoare

Quote

Ce sa zic:
1. Este o presupunere
2. Posibil
3. N-as baga mana in foc.
4. Vezi 3.  Ce intelegi prin "lucruri continand limbaj" ?

Nu inteleg daca vrei sa demonstrezi ca din 1 rezulta 4 sau invers - daca toate lucrurile ce evidentiaza utilizarea unui limbaj (containing language) sunt proiectate, deci si ceasurile si viata sunt rezultatul unui proiect, si aplicand 2, 3, ajungi la 4 din nou.

Quote

Pleci de la prezumtia ca limbajul nu poate fi decat produsul unei minti. Asta ar veni din speculatia din primul mesaj cum ca Informatia  nu poate fi decat produsa de o minte:

Quote

Care nu cred ca sunt adevarate.

The shape of life: research sheds light on how cells take shape

,,Alan Turing, father of modern computer science, suggested that the basis for pattern formation was chemical. New research conducted at Brown University and published in the Proceedings of the National Academy of Sciences supplies another surprising answer: Physical, as well as chemical, forces can dictate pattern formation."

http://www.physorg.c...ws74177251.html

Microtubule bundling and nested buckling drive stripe formation in polymerizing tubulin solutions
Full article here: http://www.pnas.org/...03/28/10654.pdf

Edited by shapeshifter, 17 August 2006 - 12:08.

Wiener:
,,Informația este informație, nici materie nici energie. Orice materialism care nu ia asta în calcul nu va supraviețui."

- Codul este definit ca comunicație între un ENCODER și un DECODER care folosește un ,,agreement” dpdv al simbolurilor
- faptul că ADN este un cod literal (la propriu) este un fapt cunoscut de după anii 60 încoace
- codul ADN are multe în comun cu limbajul uman și limbajele de calculator
- transcripția ADN este unn mecanism de encodare/decodare izomorfic cu modelul lui Shannon din 1948: secvența de perechi de baze este encodată în mesager adică ARN care e decodată în proteine.
- Termenii și conceptele teoriei informației aplicate la ADN nu sunt metaforice ci literale, adică ARGUMENTUL TEORIEI INFORMAȚIEI PENTRU DESIGN NU SE BAZEAZĂ DELOC PE ANALOGIE. ESTE APLICAREA DIRECTĂ A MATEMATICII LA ADN, CARE PRIN DEFINIȚIE ESTE UN COD.

Informația codată (așa cum e folosită de către un sistem de simboluri printr-un mecanism de encodare și decodare) este cea care transmite un mesaj care este independent de mediul de comunicare.

Exprimarea mai corectă e asta: patternul de perechi de baze din ADN formează un cod.
Molecula însăși este mediul, ordonarea perechilor de baze definește codul. ADN-ul nu este un replicator ci un mecanism de encodare/decodare. Genomul sau ansamblul mesajelor genetice este generat de un proces stationar Markov și înregistrat în secvența ADN, care este izomorfică cu banda de la mașina Turing.

Secvența de perechi de baze are o semnificație explicită în forma proteinelor pe care le codează. Semnificația este asignată în sistemul de encodare/decodare. Nu este posibil a se discuta despre decodare fără a face referire la, cel puțin, următorul layer al senificației, decodarea este asignată semnificației către o secvență de simboluri.
Corespunzător Sursei de informație din modelul lui Shannon în modelul de comunicație ADN avem Sursa - alfabet (mesajul din ADN, banda sursă) iar Destinația este tot un alfabet (mesajul proteinic din alfabetul proteinei, banda destinație) codate.. mesajului mARN din alfabetul ARN i se adaugă zgomotul genetic la ,,nivelul" mutației-punct.
Encodarea: se face prin transcripție: alfabetul ADN -> alfabetul mARN
Decodarea: ce se decodează este mesajul mARN la care s-a adăugat zgomotul genetic din codul-canal de comunicație la ,,nivelul" mutației-punct..
ADN-ul e un COD LITERAL (și nu unul FIGURATIV) din 1960 încoace.. aici nu argumentez pt. că este evident acest lucru.. oricine știe că așa este..
De la această definiție voi construi argumentația asupra faptului că ADN-ul ESTE UN COD. adică PATTERNUL DIN ADN ESTE UN COD..
Cuvintele ,,cod” și ,,simbol” nu sunt metaforic folosite în nici un text biologic științific consistent convenției ștințifice. Cărțile de știință și articolele sunt scrise foarte literal, iar cuvântul cod genetic în biologie este la fel de literal ca și cuvântul proteină. Când te uiți într-o carte de acest tip, acolo nu se spune că ADN este un ,,cod” autorul folosindu-se de ghilimele, sau că conține ,,informație” (tot cu ghilimele), sau că e ca un cod, sau că conține ceva ca informația. Acolo se spune că ADN-ul este baza pentru codul genetic, că conține informație reală, măsurabilă și că codul determină în mod unic proteinele reale.

Mai mult, nu s-a demonstrat niciodata ca mutația aleatoare poate crea INFORMAȚIE NOUĂ. Teoria informatiei arata de ce stau lucrurile asa: in sistemele de comunicatie, Mutația Aleatoare este la fel ca ZGOMOTUL, iar zgomotul distruge intotdeauna semnalul, nu-l îmbunătațește niciodată.
În sistemele de comunicatie acest lucru se numeste entropie informatională iar formula pt. aceasta entropie este identica cu cea a entropiei termodinamice. Odata pierduta, informatia nu mai poate fi nicicînd recuperata ca sa nu mai vorbim de imbunatatire. De aceea se poate spune cu certitudine (100%) ca MUTATIA ALEATOARE NU ESTE SURSA BIODIVERSITATII.

TEORIA COMUNICAȚIEI NE ARATĂ CĂ EVOLUȚIA PRIN PROCES ALEATOR ESTE O IPOTEZA FARA ACOPERIRE (DOVADĂ)..

La fel cum 0-urile și 1-urile fac lumea noastră digitală să se ,,învîrtă" așa și cu ADN-ul: ADN-ul este un sistem de comunicație digital! Iar concluzia asta nu rezult[ din analogii ci din aplicarea directă a teoriei comunicației și informației ADN-ului.. Aceleași formule și aceași teorie a comunicației care a creat era digitală modernă se aplică de asemenea și ADN-ului. Multe metode care aparțin cîmpului tehnologiei informației au fost adaptate și aplicate cercetării geneticii și Proiectului Genomului Uman..

Unde vreau să ajung cu toată discuția asta: problema CREAȚIONISM VS. EVOLUȚIONISM ESTE GREȘIT PUSĂ..
deși știu ce o să zică amenhotep, că aici nu e vorba per se despre creaționism vs. evoluționism..

PATTERNURILE CARE APAR ÎN MOD NATURAL NU NECESITĂ NICI O INTERVENȚIE DIN PARTEA UNUI ,,INTELLIGENT DESIGNER”.

Întrebarea fundamentală este:
Pot aceste proprietăți de self-organizare să producă de asemenea ADN și forme de viață?

Răspunsul la disputa CREAȚIONISM VS. EVOLUȚIONISM este.. DESIGN FOR EVOLUTION.. trecîndu-se astfel de disputa clasică nefondată dintre creaționiști și evoluționiști.. capacitatea de a evolua a fost /este ,,designed in".. deci ar fi vorba despre o potențialitate pentru evoluție, cu această potențialitate ,,built-in"..

Pe de altă parte ADN-ul reprezintă UN PLAN COMPLET PENTRU UN ORGANISM VIU. ADN-UL ESTE UN MECANISM DE ENCODARE/DECODARE CARE CONȚINE COD, SAU LIMBAJ, CARE REPREZINTĂ ORGANISMUL..
Mai mult: nici o moleculă aparută natural NU POSEDĂ PROPRIETĂȚI INFORMAȚIONALE. Natura nu produce nici un fel de cod, mecanism de encodare/decodare sau relații simbolice, orice lucru în natură se reprezintă pe el însuși!
Haosul poate produce patternuri dar nu s-a demonstrat niciodata ca produce coduri sau simboluri. Codurile și simbolurile creaza informatie, care nu este doar o proprietate a materiei si energiei. Informatia insasi este o entitate separata cuplata cu materia si energia.

Argumente pt. faptul că procesele aleatoare nu produc informație:
1. Dacă se utilizează un generator care simulează aceste mutații aleatoare cu acuratețe se observă că acestea NU crează informație
2. Zgomotul niciodată nu îmbunătățește un semnal, nu crește informația ci o diminuează (vezi ca exemplu rezonanța stohastică) deși el dă un ,,boost" recepției unui semnal
3. În teoria informației a lui Shannon, zgomotul este matematic identic cu entropia, distrugerea pe care o provoacă unui semnal este ireversibilă
4. Întreaga evoluție este ,,condusă" de către procese inteligente - fără excepție

modelul canalului de comunicație din cazul ADN-ului este izomorfic cu modelul general al comunicației unui sistem al lui Shannon..

Sursa bandă, banda ADN (alfabetul sursă) este mesajul din alfabetul ADN
Destinația bandă, banda proteină (alfabetul destinație) este mesajul proteinic din alfabetul proteinei codate
Encodarea - transcripție: alfabetul ADN -> alfabetul mARN rezultă un mesaj mARN din cadrul alfabetului ARN care este supus zgomotului genetic de-alungul întregului cod canal și în punctul mutației-punct acest zgomot genetic se ,,adaugă" mutației-punct, rezultă mesaj mARN + zgomot genetic, care este decodat prin translația (tARN ,,mischarged" combinat cu zg. genetic) care rezultă pornindu-se de la amino-acyl care sintetizează amino acizi tARN, rezultînd tARN amino-acylat, apoi rezultă tARN ,,mischarged" combinat cu zgomot genetic, acest (tARN ,,mischarged" combinat cu zg. genetic) participă la decodarea (mesajului mARN + zgomot genetic), ce rezultă este mesajul proteinic din alfabetul proteinei. Toate astea au loc în prezența continuă de-alungul codului canal a zgomotului genetic..

Cele 2 sisteme: cel din modelul lui Shannon și cel din cadrul modelului canalului de comunicație din cazul ADN sunt izomorfice..

Decodarea genomului uman înseamnă interpretarea perechilor de baze ale ADN, maparea lor funcțiilor specifice ale organismului. Motivul pentru care se face harta genomului este acela că există o relație directă între codul genetic și creatură, nu e vorba de imaginație aici. ADN codează caracteristici specifice, care se pot descoperi și defini. Decodăm genomul deoarece ,,cracking-ul" codului genetic are utilitate: ne permite să schimbăm codul (creatura), să înțelegem cum funcționează biologia, etc.

Informație, transcripție, translație, cod, redundanță, sinonim, mesager, editare, proofreading sunt termeni din biologie. Ei își împrumută semnificația din teoria informației (Shannon 1948) și NU SUNT sinonime, metafore sau analogii.

Se pare că nu s-a înțeles definiția codului, și faptul că ea se aplică indiferent dacă codul este arbitrar sau nu.
Am definit
,,INFORMAȚIA CODATĂ” ca pe un sistem de simboluri folosit de către un mecanism de encodare și decodare, care transmite un mesaj ce reprezintă o idee sau plan.

Să dau un exemplu:
Orientarea dunelor de nisip: nu există în acest caz informație codată asociată. Aceste obiecte se reprezintă DOAR PE ELE ÎNSELE, la fel ca fulgii de nea - nu există nici un mecanism de encodare/decodare în aceste obiecte materiale, precum există în ADN.

Informația din ADN este INDEPENDENTĂ DE MEDIUL DE COMUNICAȚIE, fiecare colecție de ADN din corpul nostru reprezintă un PLAN COMPLET PT. CORPUL NOSTRU, chiar dacă colecția de ADN în ea însăși este doar o secvență de simboluri făcută din chimicale (A,G,C,T). Se poate stoca un desen CAD al unui HDD pe același HDD, dar mediul și mesajul sunt 2 lucruri distinct diferite. Asemenea relații simbolice există doar în cadrul tărâmului lucrurilor vii, ele nu au loc în mod natural.

De asemenea spuneam că formularea exactă este asta:
PATTERNUL PERECHILOR DE BAZE DIN ADN ESTE UN COD.

O moleculă în ea însăși este mediul de comunicație, ordonarea perechilor de baze definește codul.

Sensul frazei ,,INDEPENDENT DE MEDIUL DE COMUNICAȚIE”:
O colecția ADN dintr-o celulă a pielii care cade de pe corpul nostru conține un plan pt. o ființă umană, chiar dacă nici celula pielii și nici colecția ADN nu sunt ființe umane. O carte reprezintă mai mult decât hârtie și cerneală, deoarece ea conține planuri și idei și instrucțiuni via INFORMAȚIE CODATĂ. Chiar dacă topica cărții este dată de hârtie și chimie, ea conține totuși planuri și idei INDEPENDENTE DE HÂRTIA ȘI CERNEALA pe care/cu care este tipărită.

Poza 1 - Schema bloc a unui sistem de comunicație generală - modelul comunicației al lui SHANNON (1948), Teoria Matematică a Comunicației
 shannon_comm_channel.JPG   55.1K   19 downloads

Poza 2 - Modelul canalului de comunicație ADN - Transmiterea mesajelor genetice de pe banda ADN pe banda proteinei.
 dna_isomorphic.JPG   79.93K   17 downloads

Observație: Sistemele de comunicație din cele 2 modele sunt IZOMORFICE!


Provocarea lui shapeshifter:
Exemple de cod: Engleza, chineza, limbajele PC, muzica, semnalele radio, apelurile telefonice, etc.
Codurile întotdeauna implică un sistem de simboluri care reprezintă idei sau planuri. Alte exemple: cântecele păsărolor, ale balenelor, sistemul de comunicație al muștei prin feromoni, etc.
Toate astea sunt derivate ale ADN-ului, OFERIȚI-MI UN SINGUR EXEMPLU DE INFORMAȚIE CODATĂ CARE APARE ÎN MOD NATURAL - în afara tărâmului vieții, în afara tărâmului ADN. Hai.. doar un exemplu..

Edited by shapeshifter, 22 August 2006 - 16:14.

Procesul de encodare/decodare din ADN are loc FĂRĂ intervenție inteligentă la fel cum un PC își actualizează automat semnăturile virușilor. Dar curgerile de apă, dunele de nisip, etc NU ENCODEAZĂ ȘI DECODEAZĂ INFORMAȚIE ÎN FELUL ACESTA.

DOAR SISTEMELE PROIECTATE (,,DESIGNED") INTELIGENT MAPEAZĂ 1:1 MODELUL LUI SHANNON.

Encodarea are loc din ,,supa” celor 4 baze către ADN.

Definiție Wikipedia:
,,ADN-ul este encodat cu 4 ,,blocuri de construcție” (,,building blocks”) interschimbabile, numite ,,baze”, care pot fi abreviate A,T,C,G, fiacare bază ,,se împerechează” doar cu o singură altă bază: A+T, T+A, C+G, G+C, adică, un ,,A” dintr-un lanț din lanțul dublu de ADN se va ,,potrivi” corect doar cu un ,,T” din alt lanț complementar. Replicarea are loc prin splituirea (dezarhivarea) lanțului dublu în partea mediană via reacții chimice relativ triviale, și prin recrearea celeilate ,,jumătăți” a fiecărui nou lanț singular prin ,,scufundarea” fiecărei jumătăți în ,,supa” făcută de cele 4 baze.”

Definiții obișnuite de dicționar:

COD – un sistem de simboluri pentru comunicație - Webster's 9th collegiate dictionary

COD GENETIC – instrucțiuni biochimice care traduc informația genetică prezentă ca o secvență liniară de tripleți nucleotide în mesagerul ARN, în secvența liniară corectă de amino acizi pentru sinteza unui lanț de peptide particular sau proteine - Random House Unabridged Dictionary

ADN – un acid nucleic care poartă informația genetică din celulă și este capabil de self-replicare și sinteză de ARN - Houghton Mifflin Dictionary

ADN (genetică)
Acid dezoxiribonucleic: o macromoleculă extrem de lungă care este componenta principală a cromozomilor și este materialul care transferă caracteristicile genetice în toate formele de viață, construit din 2 lanțuri de nucleotide înfășurate una în jurul celeilalte într-o aranjare sub formă de scară, cu părțile laterale compuse din unități alternante fosfat și dezoxiriboză și punți compuse din purină și pirimidină baze adenină, guanină, citozină, timină: informația genetică a ADN este encodată în secvența de baze și transcrisă prin desfacerea (dezcolăcirea) lanțurilor și prin replicare -Random House Unabridged Dictionary

De aceea:
Fulgii de nea, tornadele, dunele de nisip, moleculele de apă nu conțin informație codată deoarece nu există nici un sistem de simboluri, nici un mecanism de encodare/decodare, nici o transmisie a unui mesaj (pla, idee sau instrucțiuni) adică independent de mediul de comunicație. Cu alte cuvinte aceste lucrri doar se reprezintă pe ele însele.

ADN-ul conține informație codată deoarece ESTE un sistem de simboluri folosit de către UN MECANISM DE ENCODARE/DECODARE care transmite UN MESAJ (plan, idee, instrucțiuni pentru asamblarea unui organism complet). Planurile, ideile și instrucțiunile SUNT INDEPENDENTE DE MEDIUL DE COMUNICAȚIE, deoarece molecula ADN REPREZINTĂ ALTCEVA DECÂT EA ÎNSĂȘI.

Se poate demonstra că ADN-ul este IZOMORFIC CU UN SISTEM DE COMUNICAȚIE DIN INGINERIA ELECTRICĂ. De fapt această demonstrație a și fost realizată.
Encodarea, transmisia și decodarea din cadrul celulei este analoagă cu banda de înregistrare..

Codul genetic are multe proprietăți ale codurilor în general, Codul Morse, Codul Universal de Bare, Codul ASCII, codul poștal SUA, etc. Care este relația acestor coduri cu codul genetic?
Fiecare cod poate fi văzut ca un CANAL cu un alfabet de intrare AA și un alfabet de ieșire BB.

Definiția formală a codului din teoria comunicației:
Dată fiind o sursă cu spațiul de probabilitate [Omega, AA, p(AA)] și un receptor cu spațiul de probabilitate [Omega, BB, p(BB)], atunci maparea literelor alfabetului AA în literele alfabetului BB este numită un COD.
p(AA) – vectorul de probabilitate al elementelor alfabetului AA
p(BB) - vectorul de probabilitate al elementelor alfabetului BB

Natura a extins alfabetul primar al celor 4 litere la cel de 6 bit, alfabetul cu 64 de membri al codului genetic. Fiecare amino acid cu excepția triptofanului și metioninei are mai mult de un codon. Deci, codul genetic este redundant (nu degenerat).
Codul genetic este distinct și unic decodabil, deoarece codonul metionină singular AUG și uneori codonii leucină UUG și CUG, servesc ca semnal de start pentru secvența proteinică și îndeplinește aceeași funcție ca și cadrele de bare lungi de la începutul unui mesaj poștal din codul ZIP+4 și din Codul de Produs Universal. Codonii UGA, UAA și UAG funcționează ca ,,non-sens” și stopează translația proteinei din mARN și inițiază eliberarea secvenței proteinice din mARN. Ei îndeplinesc aceași funcție ca și cadrul lung de bare de la sfârșitul unui mesaj poștal de cod de bare. Aici ,,non-sens” înseamnă neasignarea nici unui sens sau nici unei semnificații în alfabetul de recepție.

Sistemul de comunicație ADN-mARN-proteom arată izomorfismul cu sistemul de comunicație standard din ingineria comunicației. Genomul, sau ansamblul mesajelor genetice, este înregistrat în secvența ADN, care este IZOMORFICĂ CU BANDA DE ÎNREGISTRARE DE LA O MAȘINĂ TURING..

Teoria Informațiai a lui Shannon nu cuantifică matematic semantica – deoarece din câte cunoaștem până acum, este imposibil. Totuși, Shannon și Weaver sunt conștienți de existența și importanța semanticii. Un mesaj trebuie să însemne ceva altfel nu e mesaj. Măsura cantitativă a zgomotului (un mesaj fără semnificație) ar putea fi exact aceeași cu a unui mesaj cu semnificație. Dar asta nu înseamnă că acestea sunt la fel. ,,Jokerii” confundă și aplică prost teoria informației. Măsura cantitativă a informației este folosită în legătură cu capacitatea canalului, și nu cu utilitatea conținutului de informație.
Teoria lui Shannon nu cuantifică conținutul semantic al unui mesaj. Cu toate astea, toate sistemele de encodare/decodare de acest tip: ADN, Ethernet, limbajele umane, TCP/IP, au o componentă semantică. Teoriile lui Shannon oferă un set de mecanisme și formule pentru verificarea faptului că decodarea a fost corect făcută astfel încât conținutul semantic este prezervat. Toate sistemele de encodare/decodare referite mai sus au mecanisme ce permit această verificare (printr-o anumită formă de redundanță). La nivelul statistic sau sintactic al unui sistem de encodare/decodare – chiar și cel din cadrul modelului lui Shannon – semnificația simbolurilor trebuie ÎNCĂ să fie asignată. Adică, prin definiție, ceea ce este decodarea. Weaver a afirmat că teoria sa nu poate cuantifica înțelesul semantic. Shannon și Weaver nu au afirmat că semnificațiiile semantice nu există. Weaver: ,,De fapt, 2 mesaje, unul dintre ele este foarte încărcat cu înțeles și celălalt este pur non-sens…” adică este recunoașterea directă de către Weaver a faptului că înțelesul este real și că este important. Weaver replică celor care spun că ,,deoarece zgomotul și datele cu semnificație apar exact la fel în cadrul teoriei sale, ele sunt echivalente”: ,,Nesiguranța care apare prin virtutea libertății de alegere din partea sender-ului este ,,nesiguranță dezirabilă”. Nesiguranța care apare din cauza erorilor sau influenței zgomotului este ,,nesiguranță nedezirabilă”. E clar unde apare jokerul când se afirmă că semnalul recepționat are mai multă informație.”

shapeshifter, your nightmare..

Edited by shapeshifter, 25 August 2006 - 16:32.

 shapeshifter, on Aug 22 2006, 16:21, said:

Ce spui de modul in care comunica intre ele sferele lui Sanduloviciu? Adevarul este ca nu stiu inca cum si daca comunica, articolul este foarte incomplet.
Apoi ar mai fi schimbul de informatie care apare la nivel de particule care sunt entangled.

Edited by landscape10, 25 August 2006 - 16:59.

-----
Apoi ar mai fi schimbul de informatie care apare la nivel de particule care sunt entangled.
-----
în afara tărâmului vieții.. informație codată, mesaj, sender-receiver.. entanglarea particulelor? și unde e sender-ul și receiver-ul? Vorbeam de mesaj și mediu: mesajul este independent de mediul de comunicație, ceea ce se confundă cu mediul de comunicație nu poartă informație codată ci doar se reprezintă pe sine, un cod este altceva decât el însuși.. haosul nu produce informație codată..

----
Ce spui de modul in care comunica intre ele sferele lui Sanduloviciu?
----
Întrebarea e asta: pot patternurile care apar în mod natural produce cod? Informație codată?

Edited by shapeshifter, 25 August 2006 - 17:08.

 shapeshifter, on Aug 25 2006, 18:02, said:

Normal ca da. Natura a creat fiinte capabile sa comunice inteligent. Codurile ADN sunt tot o creatie a naturii, si vei fi de acord cu mine daca nu cumva combati evolutia in favoarea creationismului dar nu cred ca e cazul tau. Primele caramizi ale ADN-ului au fost peptidele autoreplicante.

Edited by landscape10, 25 August 2006 - 18:25.

 shapeshifter, on Aug 25 2006, 18:02, said:

Da. :)